常见的甲状腺疾病，如甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、慢性淋巴甲状腺炎(多有甲状腺功能减退)等，属于自身免疫性疾病，不仅有甲状腺功能的异常，且有免疫功能的异常，血清中含有高浓度的抗甲状腺球蛋白抗菌素体和抗微粒体抗体。这些抗体可通过胎盘，进入胎儿体内，导致新生儿甲状腺功能减退。
母亲产后由于免疫功能的变化，可使甲亢和甲减的病情加重。母乳具有浓缩碘的能力，通过乳汁，如甲减、慢性甲状腺腺炎，会影响乳汁向婴儿提供碘，导致婴儿碘的不足，发生甲状腺功能减退，而波及脑组织和骨骼的发育。因此这种情况，不宜母乳喂养。
患甲亢的病人，产后往往病情加重，需要加大抗甲状腺药物剂量，药物可通过乳汁影响婴儿的甲状腺功能，如他巴佐母乳中浓度高于血中浓度3倍，因此每日服用较大剂量时，也不宜哺乳。母亲服放射性碘治疗，该药亦会通过乳汁，引起婴儿甲装腺功能减退。因此患此病的产妇不能喂乳。
